Główne zadania PIWet-PIB obejmują prowadzenie badań naukowych oraz prac rozwojowych, które koncentrują się na ochronie zdrowia zwierząt oraz zdrowiu publicznym, zwłaszcza w kontekście chorób odzwierzęcych. Instytut angażuje się również w badania dotyczące bezpieczeństwa żywności pochodzenia zwierzęcego oraz pasz, co jest kluczowe dla zapewnienia wysokich standardów jakości w produkcji żywności. Działania te mają na celu nie tylko rozwój naukowy, ale także praktyczne zastosowanie wyników badań w codziennej praktyce weterynaryjnej.