Zu den Hauptaufgaben des PIWet-PIB gehören die Durchführung wissenschaftlicher Forschung und Entwicklungsarbeiten, die sich auf den Tier- und Gesundheitsschutz konzentrieren, insbesondere im Hinblick auf Zoonosen. Darüber hinaus engagiert sich das Institut in der Forschung zur Sicherheit von Lebensmitteln tierischen Ursprungs sowie von Futtermitteln, was für die Gewährleistung hoher Qualitätsstandards in der Lebensmittelproduktion von entscheidender Bedeutung ist. Diese Aktivitäten zielen nicht nur auf den wissenschaftlichen Fortschritt ab, sondern auch auf die praktische Anwendung der Forschungsergebnisse im tierärztlichen Alltag.